本局組織架構為：

• 1 局長


• 2 副局長


• 3 主任秘書


• 4 直屬單位：
• 4-1 刑事警察隊
• 4-2 交通警察隊
• 4-3 保安警察隊
• 4-4 少年警察隊
• 4-5 婦幼警察隊
• 4-6 勤務指揮中心
• 4-7 民防管制中心
• 5 課室單位：
• 5-1 保安民防課
• 5-2 行政課
• 5-3 訓練課
• 5-4 後勤課
• 5-5 戶口課
• 5-6 外事課
• 5-7 陸務課
• 5-8 鑑識課
• 5-9 督察室
• 5-10 人事室
• 5-11 會計室
• 5-12 秘書室
• 5-13 公共關係室
• 5-14 保防室
• 5-15 資訊室
• 6 分局單位：
• 6-1 臺東分局
• 6-2 關山分局
• 6-3 成功分局
• 6-4 大武分局